物態與分子動力學
引自台大化學系網站
台大化學系金必耀
物質狀態變化
組成物質的原子與分子所服從的物理基本定律是已知的, 所以理論上從這些物理律出發, 我們應可得到體系的宏觀行為。 然而, 由於宏觀系統包含有極大數量的原子與分子, 所以在實際上, 宏觀物理量與微觀變數間的關聯是非常複雜的問題。 科學家為了探討這類問題, 研究發展出一些理論與方法, 藉由計算機模擬大量分子的動力學行為, 從而了解宏觀性質與微觀作用力的關聯。
動力學模擬的方法與技術, 是有相當的複雜性, 因此在計算機仍未普及的年代, 分子模擬的應用, 多半侷限於研究方面的發展。 事實上, 分子模擬的基本觀念, 是清楚而直接的, 一般中學生及大學生, 應該都能容易接受, 進而輔助相關領域之學習。 近來, 由於計算資源的普及、 教育軟體設計的發展, 縮小了研究與教學間的差距, 適合教學的分子模擬軟體, 也越來越多。 下面, 即將介紹一個相當好的分子動力學軟體。
Stark Design 分子動力學軟體
從科學研究的角度來看, 這個軟體也許並不能提供新的功能; 因為, 這個軟體的主要重點, 不是新的模擬方法或技術的應用, 而是提供一個簡單易用的分子模擬圖形介面。 StarkDesignMD 的圖形介面非常的吸引人 (參見下圖所示的馬克思威爾-波茲曼速度曲線), 又可讓使用者輕易地模擬許多複雜的現象。
整體來說, 這個軟體的設計非常好, 在一般的個人電腦或筆記型電腦上, 執行時也完全沒有遲滯的感覺。 花一些時間將此軟體下載、 安裝, 是非常值得的。 面對眼前所呈現的設計精美的視窗介面, 只需要一點實際的操作, 就能熟悉程式的介面與基本功能。 這個程式讓使用者非常容易地加入不同數目的原子, 並且能夠即時地, 將原子在二度或是三度空間的運動, 呈現在畫面上, 運算速度快到像是預先準備好的 MP3 動畫電影。 我們可以輕易的改變系統的初始狀態, 然後觀察體系隨時間的改變。 比起傳統課本上靜態的圖片或是複雜的數學公式, 似乎更有說服力, 對於輔助傳統教學是相當有幫助的。
應用實例
我們應如何解釋這個定律呢? 最好的辦法是利用氣體動力論來解釋, 試著將壓力與溫度跟微觀上原子分子的運動聯繫起來。 溫度其實就是微觀原子與分子平均動能的表現, 當系統的溫度升高時, 原子的平均速度會增加。 如果體積維持不變, 原子與容器內壁的碰撞頻率會變大, 因此原子對容器內壁所產生的壓力會隨溫度的升高而變大, 這定性地解釋了所謂的查理定律。
如果要進一步, 精確、 定量地了解這個關係, 就可能必須花一些時間推導理想氣體定律。 這樣的數學演算固然精確, 但對大部分的初學的學生來說卻不易吸收, 甚至會弄得更加糊塗。 在定性的敘述與定量的數學推演間, 分子動力學模擬扮演了橋樑的角色, 提供了一個全新的切入, 將抽象的理論關係, 連結到氣體行為的具體物理圖像。
利用 StarkDesignMD 軟體, 我們可以加入100個氦原子到系統中, 讓系統演化一段時間, 使之趨近平衡。 從最高溫開始進行模擬, 逐漸降低溫度, 在不同溫度的地方收集分子模擬的資料; 在收集一連串不同溫度點的數據後, 我們就可發現溫度與壓力之間的關係, 的確服從所謂的查理定律。 進一步,我們還可以 做各式各樣的嘗試, 檢查各種變數的改變, 對查理定律的影響。 例如, 我們可以改變原子種類, 探討原子的種類對查理定律是否會有影響; 或是加入一種以上的氣體, 看看混和氣體是否依然滿足查理定律?
其他應用
我們大力推薦 StarkDesignMD 軟體, 作為中學化學、 大學普化以及物化的補充教材。 StarkDesignMD 的各個模組的深淺不一, 有的在高中的程度, 有的則涉及到大學物理化學 的範圍。 下面所列的一些應用討論, 基本上對應到軟體中的各個模組。 但此軟體之應用應不止於所列之課題, 利用這個軟體應該還可以探討很多其他的現象, 希望你也能 提供 你的使用經驗, 將你的應用加入下面課題討論中。
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